※「さんふらわあふらの」と「さんふらわあさっぽろ」は姉妹船（同型船）であるため、客室や船内設備は同じです。ここでは主に「さんふらわあふらの」の画像を使用して紹介しています。
商船三井フェリー「さんふらわあふらの」「さんふらわあさっぽろ」の客室は、スイート、プレミアム、スーペリア、コンフォート、ツーリストの５クラスあります。ここでは、スイートと呼ばれる最も高いグレードの客室を紹介します。
スイートは、外から見ると最上階の専用バルコニーを仕切る板の間隔が広い所で、狭い所はプレミアムになります。
プレミアムに比べてかなり広くとられています。
客室内には、バス、トイレ、テレビ、冷蔵庫、専用バルコニーの設備と、パジャマ、バスタオル、フェイスタオル、バスマット、スリッパ、電気ケトル、ドライヤー、アメニティ（ボディータオル・シャンプー・コンディショナー・ボディーソープ・歯ブラシセット・コットン・綿棒・ヘアゴム）の備品が備わります。
室内は、リビングと寝室が分けられた造りになっています。
こちらはリビング部分。
全面壁で仕切られていないため、逆に開放感があります。
奥の寝室。
スイートになるとクローゼットに扉が付きます。
洗面所とトイレ。
バスルーム。
洗面所兼トイレとの仕切りがガラス張りになっています。
新日本海フェリーや太平洋フェリーのスイートだと窓が付いていますが、「さんふらわあふらの」「さんふらわあさっぽろ」はインサイドに配置されているため、外の景色を眺めながら入浴することはできません。
専用バルコニーには、夏期のみデッキチェアとテーブルが設置されます。
デッキチェアとテーブルはプレミアムクラスと同じものですが、２倍の広さがあります。
スイートルームを利用すると、レストランでの食事が乗船中、無料となります。
